60 lines
2.3 KiB
Markdown
60 lines
2.3 KiB
Markdown
<p align="center">
|
||
<img src="./res/app.png" width="100" />
|
||
</p>
|
||
<h1 align="center">CircosHeatmap-aardio</h1>
|
||
<p align="center">
|
||
一个基于 R 语言的环形热图绘制工具
|
||
</p>
|
||
|
||
<p align="center">
|
||
<img src="./res/result.jpg" width="200" />
|
||
</p>
|
||
|
||
## 📃 项目简介
|
||
|
||
CircosHeatmap-aardio 是一个基于 R 语言的环形热图（Circos Heatmap）绘制工具，支持矩阵数据的聚类与可视化。通过 Aardio 实现图形界面，使得用户无需编写代码即可轻松使用该工具。项目旨在为科研人员、数据分析师等提供一种直观、便捷的数据可视化方式。
|
||
|
||
|
||
|
||
## ✨ 核心功能
|
||
|
||
- **环形热图绘制**：基于 R 的 circlize 和 ComplexHeatmap 包，支持矩阵数据的聚类与可视化。
|
||
- **图形界面**：使用 Aardio 实现图形界面，用户可以通过界面选择输入文件、设置参数并运行脚本。
|
||
- **TODO: 自动文件格式转换**：支持自动识别 xls、xlsx、csv 文件格式，并在需要时转换为符合 R 脚本要求的临时 csv 文件。
|
||
|
||
## 📝 TODO
|
||
|
||
- **优化 UI**：进一步提升用户交互体验，增加更多可视化选项。
|
||
- **支持更多文件格式**：扩展支持更多数据文件格式。
|
||
- **增加高级功能**：如自定义颜色梯度、调整聚类参数等。
|
||
- **待补充**。
|
||
|
||
## 🛠️ 开发
|
||
|
||
1. 将 Windows 当前用户下 `appData` 目录中的 `aardio/std/r/site-library` 内容拷贝到项目中 —— 当前仓库已包含，可不用关注。
|
||
2. 将 `aardio\lib\process\r\_.aardio` 文件中：
|
||
```aardio
|
||
setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});
|
||
```
|
||
修改为：
|
||
```aardio
|
||
if (_STUDIO_INVOKED) {
|
||
// 开发环境
|
||
setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});
|
||
} else {
|
||
// 打包后环境
|
||
setLibPaths({"lib\r-library"});
|
||
}
|
||
```
|
||
|
||
**修改目的**：初次接触 aardio + R 的开发，安装 R 的相关库时遇到无法安装部分 R 库的问题，所以干脆把安装好的 R 相关库放入程序根目录下，便于将程序分发给别人使用。
|
||
|
||
**缺点**：R 库体积偏大，100MB+，不过真正需要的人应该不在乎体积吧。
|
||
|
||
## 🚀 使用
|
||
|
||
运行后会自动安装 R 语言环境。
|
||
|
||
## ✨ 贡献
|
||
|
||
欢迎贡献、建议、错误报告和修复！ |