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CircosHeatmap-aardio

项目简介

CircosHeatmap-aardio 是一个基于 R 语言的环形热图Circos Heatmap绘制工具支持矩阵数据的聚类与可视化。通过 Aardio 实现图形界面,使得用户无需编写代码即可轻松使用该工具。项目旨在为科研人员、数据分析师等提供一种直观、便捷的数据可视化方式。

核心功能

环形热图绘制:基于 R 的 circlize 和 ComplexHeatmap 包,支持矩阵数据的聚类与可视化。

图形界面:使用 Aardio 实现图形界面,用户可以通过界面选择输入文件、设置参数并运行脚本。

TODO: 自动文件格式转换:支持自动识别 xls、xlsx、csv 文件格式,并在需要时转换为符合 R 脚本要求的临时 csv 文件。

TODO

  • 优化 UI进一步提升用户交互体验增加更多可视化选项

  • 支持更多文件格式:扩展支持更多数据文件格式

  • 增加高级功能:如自定义颜色梯度、调整聚类参数等

  • 待补充

开发

1、将 Windows 当前用户下 appData 目录中的 aardio/std/r/site-library 内容拷贝到项目中 ---- 当前仓库已包含,可不用关注

2、将 aardio\lib\process\r\_.aardio 文件中:

setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});

修改为:

	if (_STUDIO_INVOKED) {
    	// 开发环境
    	setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});
	} else {
    	// 打包后环境
    	setLibPaths({"lib\r-library"});
	}

修改它的目的:初次接触 aardio + R 的开发,安装 R 的相关库时遇到无法安装部分 R 库的问题,所以干脆把安装好的 R 相关库放入程序根目录下,便于将程序分发给别人使用。 这样做缺点R 库体积偏大100MB+,不过真正需要的人应该不在乎体积吧

使用

运行后会自动安装 R 语言环境

Description
一个基于 R 的环形热图绘制工具,支持数据聚类与可视化,适用于矩阵数据的直观分析与展示。 使用 aardio 实现图形界面,便于用户使用。
Readme MIT 154 MiB
v0.1.0 Latest
2025-01-14 00:16:57 +08:00
Languages
R 100%