3.0 KiB
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CircosHeatmap-aardio
一个基于 R 语言的环形热图绘制工具
📃 项目简介
CircosHeatmap-aardio 是一个基于 R 语言的环形热图（Circos Heatmap）绘制工具，支持矩阵数据的聚类与可视化。通过 Aardio 实现图形界面，用户无需编写代码即可轻松使用该工具。
✨ 核心功能
- 环形热图绘制：基于 R 的
circlize和ComplexHeatmap包，支持矩阵数据的聚类与可视化。 - 图形界面：使用 Aardio 实现图形界面，用户可以通过界面选择输入文件、设置参数并运行脚本。
- 代码可视化与调试：内置 R 代码编辑框，用户可查看和修改当前执行的 R 脚本，便于自定义调试。
- 日志输出：提供日志窗口，实时显示脚本执行结果和错误信息。
🚀 使用教程
1. 下载并解压
从 Releases 下载并解压 CircosHeatmap-aardio。
2. 运行程序
运行 CircosHeatmap-aardio.exe，首次运行时会自动安装 R 环境。
3. 选择数据源
点击 “数据源” 选择 csv 格式的表格文件。
注意：当前仅支持 csv 格式的数据源。如果您的数据是其他格式（如 xls、xlsx），可以将其转换为 csv 格式后再使用。
4. 生成 PDF
点击 “生成 PDF” 选择 PDF 保存的位置。
🛠️ 程序功能细节
界面布局
- R 代码编辑框：显示当前执行的 R 脚本，用户可查看和修改代码。
- 日志窗口：实时显示脚本执行结果和错误信息。
- 数据源选择：通过按钮选择输入文件，支持 csv 格式。
- 生成 PDF：运行 R 脚本并保存生成的环形热图为 PDF 文件。
代码逻辑
- R 脚本加载：程序启动时自动加载默认的 R 脚本（
heatmap_script.R）。 - 文件选择：点击 “数据源” 按钮选择输入文件，路径显示在输入框中。
- 脚本执行：点击 “生成 PDF” 按钮后，程序调用 R 脚本并传入输入文件路径和输出 PDF 路径。
📝 TODO
- 优化 UI：进一步提升用户交互体验。
- 支持更多文件格式：扩展支持 xls、xlsx 等格式。
- 增加高级功能：如自定义颜色梯度、调整聚类参数等。
✨ 贡献
欢迎贡献、建议、错误报告和修复！如果您有任何想法或问题，请随时提交 Issue 或 Pull Request。