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@ -1,23 +1,37 @@
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# CircosHeatmap-aardio
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一个基于 R 的环形热图绘制工具,支持数据聚类与可视化,适用于矩阵数据的直观分析与展示。
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## 项目简介
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使用 aardio 实现图形界面,便于用户使用。
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CircosHeatmap-aardio 是一个基于 R 语言的环形热图(Circos Heatmap)绘制工具,支持矩阵数据的聚类与可视化。通过 Aardio 实现图形界面,使得用户无需编写代码即可轻松使用该工具。项目旨在为科研人员、数据分析师等提供一种直观、便捷的数据可视化方式。
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## 核心功能
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环形热图绘制:基于 R 的 circlize 和 ComplexHeatmap 包,支持矩阵数据的聚类与可视化。
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图形界面:使用 Aardio 实现图形界面,用户可以通过界面选择输入文件、设置参数并运行脚本。
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TODO: 自动文件格式转换:支持自动识别 xls、xlsx、csv 文件格式,并在需要时转换为符合 R 脚本要求的临时 csv 文件。
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## TODO
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- 自动识别输入文件格式 xls、xlsx、csv,当文件不为 csv 时自动转换一个临时 csv 文件作为程序入参
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----注意 R 脚本中所需 csv 文件的内容格式要符合脚本要求
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- 优化 UI 和提升交互便利性
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- 待补充...
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- 优化 UI:进一步提升用户交互体验,增加更多可视化选项
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- 支持更多文件格式:扩展支持更多数据文件格式
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- 增加高级功能:如自定义颜色梯度、调整聚类参数等
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- 待补充
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## 开发
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修改 `aardio\lib\process\r\_.aardio` 文件中:
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1、将 Windows 当前用户下 appData 目录中的 aardio/std/r/site-library 内容拷贝到项目中 ---- 当前仓库已包含,可不用关注
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2、将 `aardio\lib\process\r\_.aardio` 文件中:
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```aardio
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setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});
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```
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修改为
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修改为:
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```aardio
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if (_STUDIO_INVOKED) {
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// 开发环境
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@ -28,7 +42,9 @@ setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});
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}
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```
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修改它的目的:初次接触 aardio + R 的开发,安装 R 的相关库时遇到写问题,所以干脆把安装好的 R 相关库放入程序根目录下。
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修改它的目的:初次接触 aardio + R 的开发,安装 R 的相关库时遇到无法安装部分 R 库的问题,所以干脆把安装好的 R 相关库放入程序根目录下,便于将程序分发给别人使用。
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这样做缺点:R 库体积偏大,100MB+,不过真正需要的人应该不在乎体积吧
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## 使用
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运行后会自动安装 R 语言环境
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main.aardio
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main.aardio
@ -10,21 +10,15 @@ inputFile={cls="edit";left=10;top=10;right=600;bottom=40;bgcolor=16777215;edge=1
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)
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/*}}*/
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mainForm.btnRun.skin({
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btskin = {
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background={
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active=0xFFD3E0BC;
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default=0xFF8FB2B0;
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hover=0xFF928BB3
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}
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})
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mainForm.btnSelectFile.skin({
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background={
|
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active=0xFFD3E0BC;
|
||||
default=0xFF8FB2B0;
|
||||
hover=0xFF928BB3
|
||||
}
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})
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}
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mainForm.btnRun.skin(btskin);
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mainForm.btnSelectFile.skin(btskin);
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import console;
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import process.r;
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