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# CircosHeatmap-aardio
<p align="center">
<img src="./res/result.jpg" width="200" />
</p>
<h1 align="center">CircosHeatmap-aardio</h1>
<p align="center">
一个基于 R 语言的环形热图绘制工具
</p>
## 项目简介
## 📃 项目简介
CircosHeatmap-aardio 是一个基于 R 语言的环形热图Circos Heatmap绘制工具支持矩阵数据的聚类与可视化。通过 Aardio 实现图形界面,使得用户无需编写代码即可轻松使用该工具。项目旨在为科研人员、数据分析师等提供一种直观、便捷的数据可视化方式。
![demo](./res/demo.jpg)
## 核心功能
## 核心功能
环形热图绘制:基于 R 的 circlize 和 ComplexHeatmap 包,支持矩阵数据的聚类与可视化。
- **环形热图绘制**:基于 R 的 circlize 和 ComplexHeatmap 包,支持矩阵数据的聚类与可视化。
- **图形界面**:使用 Aardio 实现图形界面,用户可以通过界面选择输入文件、设置参数并运行脚本。
- **TODO: 自动文件格式转换**:支持自动识别 xls、xlsx、csv 文件格式,并在需要时转换为符合 R 脚本要求的临时 csv 文件。
图形界面:使用 Aardio 实现图形界面,用户可以通过界面选择输入文件、设置参数并运行脚本。
## 📝 TODO
TODO: 自动文件格式转换:支持自动识别 xls、xlsx、csv 文件格式,并在需要时转换为符合 R 脚本要求的临时 csv 文件。
- **优化 UI**:进一步提升用户交互体验,增加更多可视化选项。
- **支持更多文件格式**:扩展支持更多数据文件格式。
- **增加高级功能**:如自定义颜色梯度、调整聚类参数等。
- **待补充**
## TODO
## 🛠️ 开发
- 优化 UI进一步提升用户交互体验增加更多可视化选项
1. 将 Windows 当前用户下 `appData` 目录中的 `aardio/std/r/site-library` 内容拷贝到项目中 —— 当前仓库已包含,可不用关注。
2. 将 `aardio\lib\process\r\_.aardio` 文件中:
```aardio
setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});
```
修改为:
```aardio
if (_STUDIO_INVOKED) {
// 开发环境
setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});
} else {
// 打包后环境
setLibPaths({"lib\r-library"});
}
```
- 支持更多文件格式:扩展支持更多数据文件格式
**修改目的**:初次接触 aardio + R 的开发,安装 R 的相关库时遇到无法安装部分 R 库的问题,所以干脆把安装好的 R 相关库放入程序根目录下,便于将程序分发给别人使用。
- 增加高级功能:如自定义颜色梯度、调整聚类参数等
**缺点**R 库体积偏大100MB+,不过真正需要的人应该不在乎体积吧。
- 待补充
## 🚀 使用
运行后会自动安装 R 语言环境。
## 开发
## ✨ 贡献
1、将 Windows 当前用户下 appData 目录中的 aardio/std/r/site-library 内容拷贝到项目中 ---- 当前仓库已包含,可不用关注
2、将 `aardio\lib\process\r\_.aardio` 文件中:
```aardio
setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});
```
修改为:
```aardio
if (_STUDIO_INVOKED) {
// 开发环境
setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});
} else {
// 打包后环境
setLibPaths({"lib\r-library"});
}
```
修改它的目的:初次接触 aardio + R 的开发,安装 R 的相关库时遇到无法安装部分 R 库的问题,所以干脆把安装好的 R 相关库放入程序根目录下,便于将程序分发给别人使用。
这样做缺点R 库体积偏大100MB+,不过真正需要的人应该不在乎体积吧
## 使用
运行后会自动安装 R 语言环境
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BIN
res/result.jpg Normal file

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