CircosHeatmap-aardio/README.md

# CircosHeatmap-aardio

## 项目简介

CircosHeatmap-aardio 是一个基于 R 语言的环形热图（Circos Heatmap）绘制工具，支持矩阵数据的聚类与可视化。通过 Aardio 实现图形界面，使得用户无需编写代码即可轻松使用该工具。项目旨在为科研人员、数据分析师等提供一种直观、便捷的数据可视化方式。

## 核心功能

环形热图绘制：基于 R 的 circlize 和 ComplexHeatmap 包，支持矩阵数据的聚类与可视化。

图形界面：使用 Aardio 实现图形界面，用户可以通过界面选择输入文件、设置参数并运行脚本。

TODO: 自动文件格式转换：支持自动识别 xls、xlsx、csv 文件格式，并在需要时转换为符合 R 脚本要求的临时 csv 文件。

## TODO

- 优化 UI：进一步提升用户交互体验，增加更多可视化选项

- 支持更多文件格式：扩展支持更多数据文件格式

- 增加高级功能：如自定义颜色梯度、调整聚类参数等

- 待补充


## 开发

1、将 Windows 当前用户下 appData 目录中的 aardio/std/r/site-library 内容拷贝到项目中 ---- 当前仓库已包含，可不用关注

2、将 `aardio\lib\process\r\_.aardio` 文件中：
```aardio
setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});
```
修改为：
```aardio
	if (_STUDIO_INVOKED) {
    	// 开发环境
    	setLibPaths({..io.appData("aardio/std/r/site-library")});
	} else {
    	// 打包后环境
    	setLibPaths({"lib\r-library"});
	}
```

修改它的目的：初次接触 aardio + R 的开发，安装 R 的相关库时遇到无法安装部分 R 库的问题，所以干脆把安装好的 R 相关库放入程序根目录下，便于将程序分发给别人使用。
这样做缺点：R 库体积偏大，100MB+，不过真正需要的人应该不在乎体积吧

## 使用

运行后会自动安装 R 语言环境